El templo está ubicado al pie del monte Khao (1397 m), en el lado este, a 6 km del río Mekong, que simboliza el océano o el Ganges, al sur de la ciudad de Tyampatsak en la provincia de Champasak. El complejo de templos de Wat Phu ocupa un área impresionante (84 hectáreas) al pie de la montaña, que es sagrada entre los hindúes, ya que tiene la forma de un lingam (principio masculino). El complejo está frente al río.
Wat Phu se asoció originalmente con la ciudad de Shrestapura a orillas del río Mekong al este de la montaña Lingaparwata, que más tarde se conoció como Khao. En la segunda mitad del siglo V, la ciudad ya era la capital de un reino asociado a los estados de Chenla y Champa, por esta época se construyeron los primeros edificios del templo en la montaña.
El templo estaba dedicado a Shiva y las aguas del río debajo del templo se consideraban sagradas. En este templo, los maestros perfeccionaron sus habilidades, pasaron tiempo en meditación y, según algunos eruditos, el templo también se usó para sacrificios humanos.
Al menos durante el reinado de Yashovarman I en el siglo X, Wat Phu ya formaba parte del Imperio Khmer con la capital Angkor. Shrestapura se ha mudado a una nueva ciudad al sur del templo. Posteriormente, los edificios fueron reconstruidos y se utilizaron algunos de los bloques de piedra de los templos originales. El templo que ha sobrevivido hasta el día de hoy fue construido durante los períodos Koh Ker y Baphuon del siglo XI. Cuando el imperio adoptó el budismo Theravada, el complejo del templo fue reconstruido ligeramente.
En el siglo XII y XIII, los jemeres adoptaron el budismo y el templo fue recalificado como budista. Ahora, por todo el santuario se pueden ver las estatuas de Buda colocadas, pero no son tan notables como, por ejemplo, en las pagodas chinas.
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El enorme territorio del complejo está lleno de cosas maravillosas y memorables además de templos y palacios, aquí puedes ver la huella de Buda, una imagen en forma de elefante, una piedra de cocodrilo y muchas otras esculturas entretenidas.
El complejo de templos de Wat Phu fue catalogado como Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO en 2001.
