Informe sobre los resultados del análisis genético de muestras de tejido de momias encontradas en Perú. Este informe fue elaborado en noviembre de 2018.
Artistas intérpretes o ejecutantes
- Laboratorios CEN4GEN (6756 - 75 Street NW Edmonton, AB Canadá T6E 6T9): preparación y secuenciación de muestras.
- ABRAXAS BIOSYSTEMS SAPI DE CV (México) - análisis de datos informáticos.
Después de un análisis preliminar de calidad, se tomaron 3 muestras de las 7 muestras enviadas para su posterior análisis.
Muestras para análisis
| Designacion | nombre original | Nombre condicional | Imagen |
| Antiguo-0002 | Neck Bone Med Sentado 00-12 Victoria 4 | Victoria | Figura 3.117 |
| Antiguo-0003 | 1 mano 001 | Mano separada con 3 dedos | Figura 3.118 |
| Antiguo-0004 | Momia 5 - ADN | Victoria | Figura 3.117 |
Para estas muestras, se realizaron las siguientes operaciones:
Video promocional:
- Extracción de ADN.
- Control de calidad del ADN.
- Multiplicación de ADN.
- Creación de una biblioteca de ADN.
- Secuencia ADN.
- Formación de datos secuenciados purificados.
- Control de calidad.
- Análisis preliminar mediante la superposición de lecturas de ADN en el genoma humano.
- Análisis para el aislamiento de lecturas cortas de ADN típicas del ADN antiguo.
- Superposición de lecturas de ADN Ancient0003 en bibliotecas de genoma humano existentes.
- Análisis mitocondrial para la detección de variantes del bucle D y otros sitios informativos para la determinación de haplotipos mitocondriales.
- Determinación del sexo de las muestras Ancient0003.
- Identificación de posibles organismos extraños en muestras.
- Análisis de bases de datos de ADN para identificar similitudes con organismos conocidos.
Figura 3.117. Extrayendo muestras del cuello de Victoria.
Para identificar posibles tipos de organismos presentes en las muestras Ancient0004 y Ancient0002 (Victoria), se realizó un boceto de ADN genómico (Ondov et al., 2016), en el que se compararon grupos de fragmentos cortos, k-mers, con las bases de datos disponibles. Se utilizó el software BBTools.
Se probaron los siguientes organismos:
- Bacterias
- Virus.
- Plásmidos.
- Fagos.
- Hongos
- Plástido.
- Diatomeas.
- Humano.
- Bos Taurus.
- H. penzbergensis.
- PhaseolusVulgaris.
-
Mix2: Etiqueta para los siguientes genomas:
- Cloroplasto de Lotus japonicus, genoma completo.
- Canis lupus familiaris cOR9S3P pseudogén de la subfamilia S del receptor olfativo 9 (cOR9S3P) en el cromosoma 25.
- Mitocondria de Vigna radiata, genoma completo.
- Cloroplasto de Millettia pinnata, genoma completo.
- Curvibacter lanceolatus ATCC 14669 F624DRAFT_scaffold00015.15, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Asinibacterium sp. OR53 scaffold1, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Bacillus firmus cepa LK28 32, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Cloroplasto de Bupleurum falcatum, genoma completo.
- Alicycliphilus sp. B1, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Bacillus litoralis cepa C44 Scaffold1, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Cepa DSM 26898 de Chryseobacterium takakiae, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Paenibacillus sp. FSL R5-0490.
- Bacillus halosaccharovorans cepa DSM 25387 Scaffold3, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Bacteria Rhodospirillales URHD0017, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Bacillus onubensis cepa 10J4 10J4_trimmed_contig_26, secuencia completa del genoma.
- Radyrhizobium sp. MOS004 mos004_12, secuencia de escopeta de genoma completo.
- Bacillus sp. UMB0899 ERR1203650.17957_1_62.8, secuencia de escopeta de genoma completo.
-
Vertebrados: etiqueta para los siguientes genomas:
- Amblyraja-radiata_sAmbRad1_p1.fasta.
- bStrHab1_v1.p_Kakapo.fasta.
- bTaeGut1_v1.p_ZebraFinch.fasta.
- GCA_000978405.1_CapAeg_1.0_genomic_CapraAegagrus.fna.
- GCA_002863925.1_EquCab3.0_genomic_Horse.fna.
- GCF_000002275.2_Ornithorhynchus_anatinus_5.0.1_genomic.fna.
- GCF_000002285.3_CanFam3.1_genomic.fna.
- Macaco_GCF_000772875.2_Mmul_8.0.1_genomic.fna.
- rGopEvg1_p1_Gopherus_evgoodei_tortuga.fasta.
- Protozoos.
Figura 3.118. Imagen y radiografía de dos manos de tres dedos.
norte
Después de todos los filtros, se recibieron 27974521 lecturas para Ancient0002 y 304785398 lecturas para Ancient0004. Esto muestra que el 27% del ADN de la muestra Ancient0002 y el 90% del ADN de la muestra Ancient0004 no se pueden identificar con las muestras de ADN de los organismos analizados de las bases de datos disponibles.
La siguiente etapa del análisis se realizó utilizando el software megahit v1.1.3 (Li et al., 2016). Se obtuvo el siguiente resultado:
- Ancient0002: 60852 contigs, total 50459431 bp, min 300 bp, max 24990 bp, avg 829 bp, N50 868 bp, 884,385 (5.39%) lecturas ensambladas.
- Ancient0003: 54273 contigs, total 52727201 bp, min 300 bp, max 35094 bp, avg 972 bp, N50 1200 bp, 20,247,568 (65.69%) lecturas ensambladas.
El resultado del análisis se muestra en la figura.
Figura 3.116. Proporción de lecturas clasificadas para 28073655 Ancient0002 lecturas (gráfico superior) y 25084962 Ancient0004 lecturas (gráfico inferior) en comparación con la base de ADN 34904805 que representa 1109518 grupos taxonómicos.
Conclusión
Como resultado del análisis, se demostró que las muestras Ancient0002 y Ancient0004 (Victoria) no corresponden al genoma humano, mientras que la muestra Ancient0003 corresponde bien al humano.
Comentario de Korotkov K. G
Tenga en cuenta que la mano de tres dedos pertenecía a una criatura grande, comparable en tamaño a María, y el resultado obtenido corresponde al resultado del análisis de ADN de María. Victoria es representante de "pequeñas criaturas", y el resultado muestra que su ADN no coincide con ninguna criatura terrestre moderna. Naturalmente, no tenemos datos sobre criaturas antiguas que han desaparecido durante millones de años.
Enlaces
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Materiales proporcionados por Konstantin Georgievich Korotkov (Doctor en Ciencias Técnicas, Profesor, Universidad de Tecnologías de la Información, Mecánica y Óptica) y Dmitry Vladislavovich Galetsky (Candidato de Ciencias Médicas, I. P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University)
