Los bacteriófagos que contienen ADN sin cola no pueden detectarse con métodos estándar, pero ahora los científicos creen que dominan los océanos del mundo.
Cada gota de agua no muy profunda de la superficie del mar contiene alrededor de 10 millones de virus. No es de extrañar que los biólogos estén constantemente descubriendo nuevos, aunque el descubrimiento de un grupo completamente nuevo sigue siendo muy raro. Parece que las técnicas estándar simplemente no permitieron que se notaran, aunque tales virus resultaron ser extremadamente numerosos; tal vez estén muy extendidos no solo en el océano y simplemente eludieron a los científicos.
Martin Polz del Instituto de Tecnología de Massachusetts y sus colegas examinaron muestras de agua tomadas en la costa norteamericana del Océano Atlántico. Buscaron virus que contengan ADN de doble hebra; estos virus están muy extendidos, incluido el herpes, y el bacteriófago T4 (Caudovirales) familiar para todos en la escuela. Al infectar cultivos de bacterias marinas Vibrionaceae, los científicos descubrieron 200 virus de ADN diferentes, de los cuales 18 se atribuyeron al nuevo orden Autolykiviridae. Escriben sobre esto en un artículo publicado en la revista Nature.
El nombre del grupo se refiere al héroe de la mitología griega Autolycus, un ladrón astuto que es tan difícil de atrapar como estos virus. “Los virus más comunes en la Tierra son los que infectan bacterias y contienen ADN de doble hebra”, escriben Poltz y sus coautores. “Sin embargo, los Caudovirales con virus de cola, que dominan las bases de datos y colecciones de cultivos, no son representativos de su presencia en el medio ambiente. De hecho, los virus sin cola dominan las muestras de agua.
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Células bacterianas infectadas con autolykiviridae / fagos MIT, Kauffman et al., 2018.
Los bacteriófagos "sin cola" Autolykiviridae difieren en su pequeño tamaño de genoma - sólo alrededor de 10 mil bases, 4-5 veces menos que en los parientes "con cola". Su capacidad para infectar y matar células bacterianas también fue inusual. Si los fagos ordinarios en los experimentos, por regla general, afectaron a una especie específica de vibrios, estos infectaron un promedio de cuatro y condujeron a una muerte celular notablemente mayor. "Se encontró que eran responsables del 40 por ciento de las muertes bacterianas, aunque representaron alrededor del 10 por ciento del número total de virus en la muestra", explica uno de los autores del trabajo.
Las bacterias Vibrio de diferentes especies se encuentran a lo largo del perímetro del diagrama; los círculos de virus que las infectan están asociadas con ellas: bacteriófagos de "cola" azul, Autolykiviridae / MIT de color naranja - "sin cola", Kauffman et al., 2018.
Estas cifras indican el gran papel que juega el nuevo grupo Autolykiviridae en la regulación de las poblaciones bacterianas y en la biosfera en su conjunto. Los científicos confían en que su técnica ayudará a encontrar virus que anteriormente no se detectaron en el suelo y posiblemente en el intestino humano. De hecho, se encuentran secuencias genéticas similares en los genomas de bacterias en la microflora humana.
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Sergey Vasiliev
