Los científicos han descubierto en el genoma del cerdo una familia de repeticiones cortas únicas que tienen similitudes evolutivas con repeticiones similares en primates.
Científicos de la Universidad de Jilin (Changchun, China) y la Academia de Ciencias Agrícolas (Heilongjiang, China) participaron en el proyecto en cooperación con Firefly BioWorks Corporation (EE. UU.).
Después de analizar la estructura y el origen de PRE-1 (elemento de repetición porcino, literalmente, "elemento de repetición de cerdo"), llegaron a la conclusión de que los parientes más cercanos de los primates en el antiguo supercontinente Laurasia podrían ser los cerdos. La preimpresión de la investigación se publicó en el servidor bioRxiv el 31 de agosto de 2015.
La CDP (repetición dispersa corta) PRE-1 estudiada se localiza en la región intergénica, aproximadamente 686 ~ 985 pares de bases antes del inicio del gen que codifica la proteína de unión al factor de crecimiento de la insulina (IGFBP7). La secuencia repetitiva PRE-1 de 299 pares de bases se comparó con 40 repeticiones Alu de primates diferentes, y se encontraron similitudes significativas tanto en las secuencias mismas como en el patrón de distribución de sus repeticiones en los cromosomas.
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La estructura secundaria predicha de las repeticiones de ARN PRE-1 plegada en un modelo similar a las repeticiones de Alu. Finalmente, el origen común de PRE-1 y Alu a partir del llamado ARN 7SL (ARN de reconocimiento de señales) sugirió su similitud evolutiva y atribuyó a los cerdos a la familia, que incluye principalmente a los primates.
Anteriormente, para construir árboles filogenéticos, los científicos se basaban solo en las similitudes y diferencias de los genes, ignorando el hecho de que durante el curso de la evolución todo el genoma sufrió cambios, incluidos aquellos elementos que no codifican proteínas o ARN y cuyo significado aún no está claro para los científicos.
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Este estudio, basado en un enfoque integrado del análisis de elementos intergénicos, proporciona, según los autores, hechos "muy convincentes" de los que se pueden extraer conclusiones evolutivas. En particular, de acuerdo con estos resultados, el tiempo estimado de divergencia de las especies cambia de hace 65 a 80-100 millones de años.
