Los participantes del consorcio Genome 10K en la conferencia anual, que ahora tiene lugar en Nueva York, anunciaron el lanzamiento del proyecto internacional "Vertebrate Genomes", su tarea es recolectar los genomas de las 66 mil especies de vertebrados que viven hoy en el planeta. Gizmodo brinda más información sobre las metas y los objetivos del proyecto.
En 2009, los biólogos estadounidenses David Haussler, Oliver Ryder y Stephen O'Brien fundaron el proyecto Genome 10K, cuyo objetivo era secuenciar 10.000 genomas de vertebrados. Inicialmente, participaron en el proyecto 55 científicos de grandes zoológicos, centros de investigación y museos. Al principio, no estaba claro cuánto tiempo llevaría ensamblar genomas de calidad suficiente. Pero con el costo y la simplificación de los métodos de secuenciación, quedó claro que el proyecto completaría sus tareas en unos pocos años. Durante los últimos tres años, los participantes del proyecto han estado comparando las principales tecnologías para la secuenciación de ADN y el análisis de los resultados obtenidos para elegir la que creará "genomas de platino".
Ayer, los miembros de Genome 10K anunciaron el lanzamiento de un nuevo Proyecto Genoma de Vertebrados, que tiene como objetivo recolectar genomas masculinos y femeninos de 66,000 especies de vertebrados. El proyecto involucrará a 150 científicos que representan a 50 organizaciones de 12 países. Según uno de los fundadores del proyecto, Oliver Ryder, como resultado, los biólogos podrán comprender las razones de la extinción de las especies, incluso si ha habido cruces estrechamente relacionados en la historia de las especies, "cuellos de botella", como resultado de lo cual la diversidad genética de las especies o deleciones - mutaciones que pueden "apagar »Genes necesarios para la supervivencia del organismo.
Junto con el anuncio del nuevo proyecto, los científicos presentaron de inmediato los primeros resultados de su trabajo: los genomas de 15 especies de vertebrados, incluido el loro búho kakapo en peligro de extinción, endémico de Nueva Zelanda, y el ornitorrinco australiano. Estos y todos los demás genomas que los investigadores planean recopilar se publicarán en el dominio público, en la base de datos de Noah's Ark Genomic.
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Los participantes planean secuenciar secciones cortas de ADN genómico y recolectar de ellas secuencias cada vez más largas hasta el cromosoma completo, y luego "pegarlas" usando algoritmos especialmente desarrollados para el proyecto.
Anteriormente, los investigadores podían leer el genoma de una persona en un secuenciador de bolsillo del tamaño de un teléfono inteligente. El dispositivo estableció el récord de la lectura más larga de una molécula de ADN, fue capaz de secuenciar secuencias de hasta 882 mil pares de bases.
Ekaterina Rusakova
